衛生泵的應用對人體健康密切相關，首要目標是保證生產流程沒有細菌、微生物，沒有有毒物質產生，不予輸送的介質發生反應，并保證完美清潔無殘留，其次要符合相關標準的規定。不應對泵送介質產生損害，對剪切十分敏感的物料，衛生泵的選擇要慎重。特定泵的選擇取決于許多因素，包括泵的排送量、輸送壓力和吸入口狀態等，需要考慮系統中實際剪切率和溫度條件下流體的粘度。

①儲罐中（低剪切率）的粘度
②管線中（中剪切率）的粘度
③泵中（高剪切率）的粘度
剪切敏感性流體由于會在工作中變質，所以通常要使用低剪切的容積式泵（如軟管泵），抽送速度也要相應的加以選擇。
選用的產品不對產品種的固形物產生破壞（比如果粒）。
如果產品具有磨粒磨損特性，或含有懸浮的硬質固體顆粒，選用較低的轉速（不能發生顆粒沉降）。
溫度影響吸入性能，考慮NPSHr。
輸送溫度較高的介質，必須考慮部件之間不同的熱膨脹率。
引起摩擦副密封失效的因素主要有：a衛生泵在操作中，因抽空、氣蝕、憋壓等異常現象，引起較大的軸向力，使動、靜環接觸面分離；b對安裝機械密封時壓縮量過大，導致摩擦副端面嚴重磨損、擦傷；c衛生泵的動環密封圈過緊，彈簧無法調整動環的軸向浮動量；d衛生泵的靜環密封圈過松，當動環軸向浮動時，靜環脫離靜環座；e衛生泵在運轉時有顆粒狀物質，運轉中進人摩擦副，探傷動、靜環密封端面；f設計選型有誤，密封端面比壓偏低或密封材質冷縮性較大等。
    衛生泵的結構較為簡單，在試運轉時如發生泄漏情況可先適當的調整操作方法和使用工況，如還未得到解決，則根據以上條件進行排查，更換或修復有損傷的配件。